Полиморфизм гена FTO rs9939609 в популяциях коренного населения Севера Западной Сибири

Аннотация

Введение. Пополнение и уточнение геногеографической картины гена FTO (rs9939609) является актуальной задачей, поскольку носительство аллеля A*FTO ассоциировано с повышенным риском развития ожирения, сахарного диабета 2 типа, ишемической болезни сердца. Важно также накопление данных о частотах аллелей FTO в группах населения с различными вариантами традиционного природопользования и питания.

Цель исследования: дать характеристику распределения частот аллеля A*FTO (rs9939609) в популяциях коренного населения Севера Западной Сибири.

Материалы и методы. В общую выборку (N=171) вошли северные ханты (n=90), сосьвинские манси (n=31), ямальские ненцы (n=50). Проведено генотипирование выделенной из образцов крови геномной ДНК по полиморфному локусу гена FTO rs9939609.

Результаты демонстрируют близость западносибирских выборок по частотам аллелей и генотипов. Средняя частота носительства аллеля *A в популяциях Севера Западной Сибири составляет 0,377. Значимых различий между этническими выборками (ханты, манси, ненцы) по частотам аллеля *A и генотипа AA*FTO не выявлено (p>0,05).

Обсуждение. Для обследованных групп характерно невысокое носительство «рисковых» вариантов полиморфизма FTO rs9939609. Выборки хантов, манси и ямальских ненцев не различаются по частотам аллеля A* и генотипа AA*FTO и близки к описанным в группах тазовских ненцев (Батурин с соавт., 2017), калмыков и монголов, хотя значимо (p<0,05) ниже, чем у алтайцев и русских (Бондарева с соавт., 2018).

Заключение. Поскольку распределение аллеля A*FTO в наших выборках отвечает равновесию Харди-Вайнберга, а ранговые корреляции Спирмена между популяционными частотами генотипов FTO с географической широтой и климатическими характеристиками области проживания 16 популяций Евразии не достигают принятого уровня значимости (p>0,2), можно предположить, что в современных популяциях полиморфизм FTO rs9939609 не вовлечён в процессы адаптации к условиям высокоширотных регионов.

Решение вопроса о специфике распределения аллелей и генотипов FTO rs9939609 в популяциях, представляющих различные расовые группы и адаптивные типы, требует расширения географического охвата и привлечения более обширного материала.

Благодарности. Исследование выполнено в рамках государственного задания МГУ имени М.В.Ломоносова (для А.А Васильевой, А.И. Козлова, Г.Г. Вершубской) и государственного задания для ФГБНУ «МГНЦ».

 

Литература

Батурин А.К., Сорокина Е.Ю., Погожева А.В., Кешабянц Э.Э., Кобелькова И.В. с соавт. Изучение ассоциации полиморфизмов rs993609 гена FTO и rs659366 гена UCP2 с ожирением у населения Арктической зоны Российской Федерации // Вопросы питания. 2017. Т. 86. № 3. С. 32-39.

Бондарева Э.А., Махалин А.В., Попова Е.В., Отгон Г., Задорожная Л.В. с соавт. Предрасположенность к ожирению среди различных этнических групп на территории России и Монголии, обусловленная полиморфизмом гена FTO. Вестник Московского университета. Серия XXIII. Антропология, 2018. № 4. С. 43-48. https://doi.org/10.32521/2074-8132.2018.4.043-048

Головнев А.В. Историческая типология хозяйства народов Северо-Западной Сибири. Новосибирск: НГУ. 1993. 204 c. ISBN: 5-7615-0121-X.

Козлов А.И., Лавряшина М.Б., Вершубская Г.Г., Балановская Е.В. Своеобразие субэтнических групп ненцев по генетическим детерминантам метаболизма сахарозы, трегалозы и лактозы // Вестник Московского университета. Серия XXIII. Антропология, 2022, № 3. С. 63-71. https://doi.org/10.32521/2074-8132.2022.3.063-071

Хомич Л.В. Проблемы этногенеза и этнической истории ненцев. Л.: Наука. 1976. 189 с.

Al-Serri A., Al-Bustan S.A., Kamkar M., Thomas D., Alsmadi O. et al. Association of FTO rs9939609 with obesity in the Kuwaiti population: a public health concern? Med. Princ. Pract., 2018, 27 (2), pp. 145-151. https://doi.org/10.1159/000486767

Church C., Moir L., McMurray F., Girard C., Banks G.T. et al. Overexpression of Fto leads to increased food intake and results in obesity. Nat. Genet., 2010, 42 (12), pp. 1086-1092. https://doi.org/10.1038/ng.713

Derenko M., Malyarchuk B., Denisova G., Perkova M., Litvinov A. et al. Western Eurasian ancestry in modern Siberians based on mitogenomic data. BMC Evol. Biol., 2014, 14, p. 217. https://doi.org/10.1186/s12862-014-0217-9

Fischer J., Koch L., Emmerling C., Vierkotten J., Peters T. et al. Inactivation of the Fto gene protects from obesity. Nature, 2009, 458, pp. 894-898. https://doi.org/10.1038/nature07848

Frayling Т.М., Timpson N.J., Weedon М.N., Zeggini E., Freathy R.M. et al. А common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes tо childhood and adult obesity. Science, 2007, 316 (5826), pp. 889-894. https://doi.org/10.1126/science.1141634

Hardy D.S., Garvin J.T., Mersha T.B., Racette S.B. Ancestry specific associations of FTO gene variant and metabolic syndrome: A longitudinal ARIC study. Medicine (Baltimore), 2020, 99 (6), pp. e18820. https://doi.org/10.1097/MD.0000000000018820

Hinney A., Nguyen T.T., Scherag A., Friedel S., Brцnner G. et al. Genome wide association (GWA) study for early onset extreme obesity supports the role of fat mass and obesity associated gene (FTO) variants. PLoS One, 2007, 2 (12), p. e1361. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0001361

Inandiklioğlu N., Yaşar A. Association between rs1421085 and rs9939609 polymorphisms of fat mass and obesity-associated gene with high-density lipoprotein cholesterol and triglyceride in obese Turkish children and adolescents. J. Pediatr. Genet., 2021, 10 (1), pp. 9-15. https://doi.org/10.1055/s-0040-1713154

Kaakinen M., Läärä E., Pouta A., Hartikainen A.L., Laitinen J. et al. Life-course analysis of a fat mass and obesity-associated (FTO) gene variant and body mass index in the Northern Finland Birth Cohort 1966 using structural equation modeling. Am. J. Epidemiol., 2010, 172 (6), pp. 653-665. https://doi.org/10.1093/aje/kwq178

Kozlov A., Vershubsky G., Kozlova M. Indigenous Peoples of Northern Russia: Anthropology and Health. Int. J. Circumpolar Health, 2007, 66 (sup1), pp. 1-184. https://doi.org/10.1080/22423982.2007.11864603

Krupnik I. Arctic adaptations: native whalers and reindeer herders of Northern Eurasia. Hanover, University Press of New England, 1993. 355 pp.

Kucher A.N. The FTO Gene and Diseases: The Role of Genetic Polymorphism, Epigenetic Modifications, and Environmental Factors. Russ. J. Genet., 2020, 56, pp. 1025–1043. https://doi.org/10.1134/S1022795420090136

Malyarchuk B.A., Litvinov A.N. Polymorphism of the rs1421085 Locus of the FTO Gene in Human Populations: Genogeographic Aspect. Russ. J. Genet., 2025, 61, pp. 453-459. https://doi.org/10.1134/S1022795424701850

Park H.G., Choi J.H. Genetic variant rs9939609 in FTO is associated with body composition and obesity risk in Korean females. BMJ Open Diabet. Res. Care, 2023, 11 (6), p. e003649. https://doi.org/10.1136/bmjdrc-2023-003649

Peters T., Ausmeier K., Rüther U. Cloning of Fatso (Fto), a novel gene deleted by the Fused toes (Ft) mouse mutation. Mamm. Genome, 1999, 10 (10), p. 983–986. https://doi.org/10.1007/s003359901144

Pimenoff V.N., Comas D., Palo J.U., Vershubsky G., Kozlov A. et al. Northwest Siberian Khanty and Mansi populations in the junction of West and East Eurasian gene pools as revealed by uniparental markers. Eur. J. Hum. Genet., 2008, 16 (10), pp. 1254-1264. https://doi.org/10.1038/ejhg.2008.101

Tan L.-J., Zhu H., He H., Wu K.-H., Li J. et al. Replication of 6 obesity genes in a meta-analysis of genome-wide association studies from diverse ancestries. PLoS ONE, 2014, 9 (5), p. e96149. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096149

Ursu R.I., Badiu C., Cucu N., Ursu G.F., Craciunescu I. et al. The study of the rs9939609 FTO gene polymorphism in association with obesity and the management of obesity in a Romanian cohort. J. Med. Life, 2015, 8 (2), pp. 232-238.

West N.R., Dorling J., Thackray A.E., Hanson N.C., Decombel S.E. et al. Effect of obesity-linked FTO rs9939609 variant on physical activity and dietary patterns in physically active men and women. J. Obes., 2018, 2018, p. 7560707. https://doi.org/10.1155/2018/7560707